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JP-2026514785-A - 新規化合物およびその用途

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Abstract

本発明は、新規化合物およびその用途に関し、より具体的には、生体分子（例えば、核酸、タンパク質など）の標識が可能な化合物、前記化合物を含む生体分子標識または検出用組成物、前記化合物を含む生体分子標識または検出用支持体および前記化合物を用いて生体分子を標識または検出する方法に関する。

Inventors

  • イ、ドミン
  • キム、ソヨン
  • チェ、サンドン
  • スディプクマール、サフ
  • グータム、マサンタ
  • オム、ミンス
  • カン、ジス
  • シ、ホヨン
  • ティナ、コライ
  • チャン、ウンチョン
  • イム、ヒョンジュ
  • ソン、ジュマン

Assignees

  • エスエフシー カンパニー リミテッド

Dates

Publication Date
20260513
Application Date
20240425
Priority Date
20230428

Claims (20)

  1. 下記の化学式１で表される化合物： ここで、 Ｒ １ ～Ｒ ４ は、それぞれ独立に水素、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ アルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ アルキニル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルキル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ ヘテロシクロアルキル、ヒドロキシ、オキシド（－Ｏ － ）、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ４０ シクロアルキルオキシ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ４０ アリールオキシ、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ ヘテロアリールオキシ、チオール、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ５０ アルアルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルキルチオ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ４０ アリールチオ、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ４０ シクロアルキルチオ、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ ヘテロアリールチオ、置換されていてもよいアシルアミノ、アシルオキシ、スルホ基（ｓｕｌｆｏ ｇｒｏｕｐ)、置換されていてもよいアンモニウム、置換されたスルホン酸エステル、置換されていてもよいスルホンアミド、置換されたエステル、置換されていてもよいアミノカルボニル、ニトロソ（－Ｎ＝Ｏ）、置換されていてもよいシリル、置換されていてもよいアミド、置換されていてもよいカルバメート、ホスホ基（ｐｈｏｓｐｈｏ ｇｒｏｕｐ)、ニトリル、アセタール、ケタール、置換されていてもよいアミノ、アミノチオカルボニル、アミノカルボニルオキシ、アミノスルホニルオキシ、アミジノ基、スルホニルオキシ、イソニトリル、シアネート、イミド、イミニウム、エーテル、チオエーテル、Ｒ ｘ およびＲ ｓ から選択され、 Ｒ ５ ～Ｒ １３ は、それぞれ独立に水素、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ アルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ アルキニル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルキル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ ヘテロシクロアルキル、ヒドロキシ、オキシド（－Ｏ － ）、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルコキシ、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ４０ シクロアルキルオキシ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ４０ アリールオキシ、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ ヘテロアリールオキシ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ５０ アリール、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ５０ ヘテロアリール、チオール、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ５０ アルアルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルキルチオ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ４０ アリールチオ、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ４０ シクロアルキルチオ、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ ヘテロアリールチオ、置換されていてもよいアシルアミノ、アシルオキシ、スルホ基（ｓｕｌｆｏ ｇｒｏｕｐ)、置換されていてもよいアンモニウム、置換されたスルホン酸エステル、置換されていてもよいスルホンアミド、置換されたエステル、置換されていてもよいアミノカルボニル、ニトロソ（－Ｎ＝Ｏ）、ハロゲン、置換されていてもよいシリル、置換されていてもよいアミド、置換されていてもよいカルバメート、ホスホ基（ｐｈｏｓｐｈｏ ｇｒｏｕｐ)、ニトリル、アセタール、ケタール、置換されていてもよいアミノ、アミノチオカルボニル、アミノカルボニルオキシ、アミノスルホニルオキシ、アミジノ基、スルホニルオキシ、イソニトリル、シアネート、イミド、イミニウム、エーテル、チオエーテル、Ｒ ｘ およびＲ ｓ から選択され、 Ｒ １ ～Ｒ １３ のうち隣接する２つは、互いに結合して置換されていてもよい脂肪族環、置換されていてもよい芳香族環または置換されていてもよい脂肪族および芳香族混合環を形成することができ、 Ａ １ およびＡ ２ は、それぞれ独立に水素、ハロゲン、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ １０ アルキル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ １０ シクロアルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ １０ ヘテロシクロアルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ １０ ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ １０ アルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ １０ アルキニル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ １０ アルコキシ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ４０ アリールオキシおよびシアノから選択され、ただし、Ａ １ およびＡ ２ が同時に水素である場合を除き、 Ｒ ｘ は、反応基であるか、１～４０個の炭素原子を含む炭化水素を含むバックボーンに少なくとも１つの反応基が結合した基であり、 前記反応基は、カルボキシル、カルボキシル誘導体、カルボキシレート（－ＣＯ ２ － ）、カルボン酸塩、ヒドロキシル、親ジエン体、アルデヒド、置換されたケトン、スルホニルハライド、チオール、非置換されたアミノ、一級アミノ、アルケン、アルキン、ハロゲン、ヒドラジド、アジド、イミド、ケテン、イソシアネート、チオシアネート、イソチオシアネート、エポキシド、マレイミド、１，２，４，５－テトラジン誘導体、シクロアルキン誘導体、シクロアルケン、トリホスフェートおよびホスホロアミダイト、置換されたチオケトン、ハロホルミル、ホルミル、アシル、アシルアミド、アシルアジド、有機酸無水物（ａｎｈｙｄｒｉｄｅ）、アニリン、アジリジン、ボロネート、カルボジイミド、ジアゾアルキン、ハロアセトアミド、イミドエステル、グリコール、ハロトリアジン、ヒドラジン、アシルハライド、アルキルハライドおよびアリールハライドから選択される官能基であり、 Ｒ ｓ は、キャリア分子（ｃａｒｒｉｅｒ ｍｏｌｅｃｕｌｅ）であるか、１～４０個の炭素原子を含む炭化水素を含むバックボーンに少なくとも１つのキャリア分子（ｃａｒｒｉｅｒ ｍｏｌｅｃｕｌｅ）が結合した基であり、 Ｒ １ ～Ｒ １３ のうち少なくとも１つは、Ｒ ｘ またはＲ ｓ であり、 Ｘは、Ｏ、Ｓ、ＣＲ ａ Ｒ ｂ 、ＮＲ ａ またはＳｉＲ ａ Ｒ ｂ であり、 Ｒ ａ およびＲ ｂ は、それぞれ独立に置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ３０ シクロアルキル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ３０ ヘテロシクロアルキル、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ５０ アリールおよび置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ５０ ヘテロアリールから選択されるか、互いに結合して形成された置換されていてもよい脂肪族環、置換されていてもよい芳香族環または置換されていてもよい脂肪族および芳香族混合環である。
  2. Ｒ ｘ またはＲ ｓ は、下記の構造式１を含むことを特徴とする請求項１に記載の化合物： ここで、 ＊は、構造式１が化学式１で表される化合物に結合する位置を示し、 Ｒ １４ およびＲ １５ は、それぞれ独立に水素、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ２０ アルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ２０ ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ アルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ アルキニル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルキル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ ヘテロシクロアルキル、ヒドロキシ、オキシド（－Ｏ － ）、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルコキシ、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルキルオキシ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ２０ アリールオキシ、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ ヘテロアリールオキシ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ２０ アリール、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ ヘテロアリール、チオール、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ２０ アルアルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ２０ アルキルチオ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ２０ アリールチオ、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルキルチオ、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ ヘテロアリールチオ、置換されていてもよいアシルアミノ、アシルオキシ、スルホ基（ｓｕｌｆｏ ｇｒｏｕｐ)、置換されていてもよいアンモニウム、置換されたスルホン酸エステル、置換されていてもよいスルホンアミド、置換されたエステル、置換されていてもよいアミノカルボニル、ニトロソ（－Ｎ＝Ｏ）、ハロゲン、置換されていてもよいシリル、置換されていてもよいアミド、置換されていてもよいカルバメート、ホスホ基（ｐｈｏｓｐｈｏ ｇｒｏｕｐ)、ニトリル、アセタール、ケタール、置換されていてもよいアミノ、アミノチオカルボニル、アミノカルボニルオキシ、アミノスルホニルオキシ、アミジノ基、スルホニルオキシ、イソニトリル、シアネート、イミド、イミニウム、エーテルおよびチオエーテルから選択されるか、互いに結合して置換されていてもよい脂肪族環、置換されていてもよい芳香族環または置換されていてもよい脂肪族および芳香族混合環を形成し、 Ｌ １ は、単結合であるか、１～２０個の炭素原子を含む炭化水素を含むリンカーである。
  3. Ｒ １４ およびＲ １５ のうち少なくとも１つは、カルボキシル、カルボキシル誘導体、カルボキシレート（－ＣＯ ２ － ）、カルボン酸塩、ヒドロキシル、親ジエン体、アルデヒド、置換されたケトン、スルホニルハライド、チオール、非置換されたアミノ、一級アミノ、アルケン、アルキン、ハロゲン、ヒドラジド、アジド、イミド、ケテン、イソシアネート、チオシアネート、イソチオシアネート、エポキシド、マレイミド、１，２，４，５－テトラジン誘導体、シクロアルキン誘導体、シクロアルケン、トリホスフェートおよびホスホロアミダイト、置換されたチオケトン、ハロホルミル、ホルミル、アシル、アシルアミド、アシルアジド、有機酸無水物（ａｎｈｙｄｒｉｄｅ）、アニリン、アジリジン、ボロネート、カルボジイミド、ジアゾアルキン、ハロアセトアミド、イミドエステル、グリコール、ハロトリアジン、ヒドラジン、アシルハライド、アルキルハライドおよびアリールハライドから選択される反応基を含むことを特徴とする請求項２に記載の化合物。
  4. Ｒ ｘ またはＲ ｓ は、下記の構造式２を含むことを特徴とする請求項１に記載の化合物： ここで、 ＊は、構造式２が化学式１で表される化合物に結合する位置を示し、 Ｒ １６ は、水素、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ２０ アルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ２０ ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ アルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ アルキニル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルキル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ ヘテロシクロアルキル、ヒドロキシ、オキシド（－Ｏ － ）、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルコキシ、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルキルオキシ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ２０ アリールオキシ、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ ヘテロアリールオキシ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ２０ アリール、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ ヘテロアリール、チオール、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ２０ アルアルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ２０ アルキルチオ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ２０ アリールチオ、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルキルチオ、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ ヘテロアリールチオ、置換されていてもよいアシルアミノ、アシルオキシ、スルホ基（ｓｕｌｆｏ ｇｒｏｕｐ)、置換されていてもよいアンモニウム、置換されたスルホン酸エステル、置換されていてもよいスルホンアミド、置換されたエステル、置換されていてもよいアミノカルボニル、ニトロソ（－Ｎ＝Ｏ）、ハロゲン、置換されていてもよいシリル、置換されていてもよいアミド、置換されていてもよいカルバメート、ホスホ基（ｐｈｏｓｐｈｏ ｇｒｏｕｐ)、ニトリル、アセタール、ケタール、置換されていてもよいアミノ、アミノチオカルボニル、アミノカルボニルオキシ、アミノスルホニルオキシ、アミジノ基、スルホニルオキシ、イソニトリル、シアネート、イミド、イミニウム、エーテルおよびチオエーテルから選択され、 Ｌ ２ は、１～２０個の炭素原子を含む炭化水素を含むリンカーである。
  5. 前記化合物に少なくとも１つのＲ ｘ または少なくとも１つのＲ ｓ が存在し、少なくとも１つのＲ ｘ または少なくとも１つのＲ ｓ は、保護基で保護されたことを特徴とする請求項１に記載の化合物。
  6. Ａ １ およびＡ ２ のうち少なくとも１つは、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ３ アルキルおよび置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ５ アルコキシ基から選択されることを特徴とする請求項１に記載の化合物。
  7. Ｒ １ とＲ ５ 、Ｒ ２ とＲ ６ 、Ｒ ３ とＲ １０ およびＲ ４ とＲ ９ のうち少なくとも一対は、互いに結合して置換されていてもよい脂肪族環、置換されていてもよい芳香族環または置換されていてもよい脂肪族および芳香族混合環を形成することを特徴とする請求項１に記載の化合物。
  8. Ｒ １ とＲ ２ およびＲ ３ とＲ ４ のうち少なくとも一対は、互いに結合して置換されていてもよい脂肪族環、置換されていてもよい芳香族環または置換されていてもよい脂肪族および芳香族混合環を形成することを特徴とする請求項１に記載の化合物。
  9. 下記の化学式２で表される化合物： ここで、 Ｒ ２１ ～Ｒ ２４ は、それぞれ独立に水素、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ アルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ アルキニル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルキル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ ヘテロシクロアルキル、ヒドロキシ、オキシド（－Ｏ － ）、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ４０ シクロアルキルオキシ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ４０ アリールオキシ、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ ヘテロアリールオキシ、チオール、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ５０ アルアルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルキルチオ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ４０ アリールチオ、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ４０ シクロアルキルチオ、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ ヘテロアリールチオ、置換されていてもよいアシルアミノ、アシルオキシ、スルホ基（ｓｕｌｆｏ ｇｒｏｕｐ)、置換されていてもよいアンモニウム、置換されたスルホン酸エステル、置換されていてもよいスルホンアミド、置換されたエステル、置換されていてもよいアミノカルボニル、ニトロソ（－Ｎ＝Ｏ）、置換されていてもよいシリル、置換されていてもよいアミド、置換されていてもよいカルバメート、ホスホ基（ｐｈｏｓｐｈｏ ｇｒｏｕｐ)、ニトリル、アセタール、ケタール、置換されていてもよいアミノ、アミノチオカルボニル、アミノカルボニルオキシ、アミノスルホニルオキシ、アミジノ基、スルホニルオキシ、イソニトリル、シアネート、イミド、イミニウム、エーテル、チオエーテルおよび－Ｌ ３ －Ｒ ３６ から選択され、 Ｒ ２５ ～Ｒ ３３ は、それぞれ独立に水素、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ アルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ アルキニル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルキル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ２０ シクロアルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ２０ ヘテロシクロアルキル、ヒドロキシ、オキシド（－Ｏ － ）、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルコキシ、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ４０ シクロアルキルオキシ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ４０ アリールオキシ、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ ヘテロアリールオキシ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ５０ アリール、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ５０ ヘテロアリール、チオール、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ５０ アルアルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルキルチオ、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ４０ アリールチオ、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ４０ シクロアルキルチオ、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ４０ ヘテロアリールチオ、置換されていてもよいアシルアミノ、アシルオキシ、スルホ基（ｓｕｌｆｏ ｇｒｏｕｐ)、置換されていてもよいアンモニウム、置換されたスルホン酸エステル、置換されていてもよいスルホンアミド、置換されたエステル、置換されていてもよいアミノカルボニル、ニトロソ（－Ｎ＝Ｏ）、ハロゲン、置換されていてもよいシリル、置換されていてもよいアミド、置換されていてもよいカルバメート、ホスホ基（ｐｈｏｓｐｈｏ ｇｒｏｕｐ)、ニトリル、アセタール、ケタール、置換されていてもよいアミノ、アミノチオカルボニル、アミノカルボニルオキシ、アミノスルホニルオキシ、アミジノ基、スルホニルオキシ、イソニトリル、シアネート、イミド、イミニウム、エーテル、チオエーテルおよび－Ｌ ３ －Ｒ ３６ から選択され、 Ｒ ２１ ～Ｒ ３３ のうち隣接する２つは、互いに結合して置換されていてもよい脂肪族環、置換されていてもよい芳香族環または置換されていてもよい脂肪族および芳香族混合環を形成することができ、 Ａ ３ およびＡ ４ は、それぞれ独立に水素、ハロゲン、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ １０ アルキル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ １０ シクロアルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ １０ ヘテロシクロアルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ １０ ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ １０ アルケニル、置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ １０ アルキニル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ １０ アルコキシ、置換されていてもよいアリールオキシおよびシアノから選択され、ただし、Ａ ３ およびＡ ４ が同時に水素である場合を除き、 Ｘは、Ｏ、Ｓ、ＣＲ ａ Ｒ ｂ 、ＮＲ ａ またはＳｉＲ ａ Ｒ ｂ であり、 Ｒ ａ およびＲ ｂ は、それぞれ独立に置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ アルキル、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ ４０ ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ３０ シクロアルキル、置換されていてもよいＣ ３ －Ｃ ３０ ヘテロシクロアルキル、置換されていてもよいＣ ５ －Ｃ ５０ アリールおよび置換されていてもよいＣ ２ －Ｃ ５０ ヘテロアリールから選択されるか、互いに結合して形成された置換されていてもよい脂肪族環、置換されていてもよい芳香族環または置換されていてもよい脂肪族および芳香族混合環であり、 Ｒ ２１ ～Ｒ ３３ のうち少なくとも１つは、－Ｌ ３ －Ｒ ３６ であり、 Ｌ ３ は、１～４０個の炭素原子を含む炭化水素を含むリンカーであり、 Ｒ ３６ は、下記の化学式３～化学式５から選択されるヌクレオシドであり、 ここで、 ＊は、前記ヌクレオシドがＬ ３ に結合する位置を示し、 Ｂは、核塩基（ｎｕｃｌｅｏｂａｓｅ）であり、 Ｒ ４０ は、水素、－Ｐ（ＯＲ ４３ ）（Ｎ（Ｒ ４４ Ｒ ４５ ））および－Ｌ ４ －Ｒ ４６ から選択され、 Ｒ ４１ は、アルコール保護基（ａｌｃｏｈｏｌ ｐｒｏｔｅｃｔｉｎｇ ｇｒｏｕｐ）、水素または－Ｐ（ＯＲ ４３ ）（Ｎ（Ｒ ４４ Ｒ ４５ ））であるか、置換されていてもよい支持体（ｓｕｐｐｏｒｔ）または核酸であり、 Ｒ ４３ ～Ｒ ４５ は、それぞれ独立に水素、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ １０ アルキルおよび置換されていてもよいＣ １ －Ｃ １０ ヘテロアルキルから選択され、 Ｌ ４ は、単結合であるか、ヌクレオチド間のホスホジエステル結合、置換されていてもよいＣ １ －Ｃ １０ アルキルおよび置換されていてもよいＣ １ －Ｃ １０ ヘテロアルキルから選択され、 Ｒ ４６ は、ヒドロキシまたは－Ｐ（ＯＲ ４３ ）（Ｎ（Ｒ ４４ Ｒ ４５ ））であるか、置換されていてもよい支持体（ｓｕｐｐｏｒｔ）または核酸であり、 Ｒ ４２ は、水素、ヒドロキシ、アルコキシおよび－ＯＲ ｐ から選択されるいずれか１つであり、 Ｒ ｐ は、保護基（Ｐｒｏｔｅｃｔｉｎｇ ｇｒｏｕｐ）である。
  10. 置換されていてもよい支持体（ｓｕｐｐｏｒｔ）または核酸は、クマリン、シアニン、ボディピ、フロセイン、ローダミン、ピレン、カルボピロニン、オキサジン、キサンテン、チオキサンテン、アクリジンおよびまたはこれらの誘導体および化学式１から選択された少なくとも１つで置換された支持体（ｓｕｐｐｏｒｔ）または核酸であることを特徴とする請求項９に記載の化合物。
  11. 請求項１から１０のいずれか一項に記載の化合物が標識用レポーターであることを特徴とする化合物。
  12. 請求項１から１０のいずれか一項に記載の化合物を標識用レポーターとして含むコンジュゲート。
  13. 前記コンジュゲートは、ヌクレオチドコンジュゲートであることを特徴とする請求項１２に記載のコンジュゲート。
  14. 前記コンジュゲートは、プローブまたはプライマーであることを特徴とする請求項１２に記載のコンジュゲート。
  15. マイナーグループバインダー（ＭＧＢ；ｍｉｎｏｒ ｇｒｏｏｖｅ ｂｉｎｄｅｒ）をさらに含むことを特徴とする請求項１２に記載のコンジュゲート。
  16. 請求項１から１０のいずれか一項に記載の化合物；および 消光子； を含むコンジュゲート。
  17. 請求項１から１０のいずれか一項に記載の化合物；および ２つ以上の消光子； を含むコンジュゲート。
  18. 前記消光子は、アゾ、クマリン、シアニン、ボディピ、フロセイン、ローダミン、ピレン、カルボピロニン、オキサジン、キサンテン、チオキサンテン、アクリジンおよびこれらの誘導体から選択される少なくとも１つであることを特徴とする請求項１６に記載のコンジュゲート。
  19. 請求項１２に記載のコンジュゲートを含む核酸検出用組成物。
  20. 請求項１から１０のいずれか一項に記載の化合物； 支持体；および 前記レポーターと前記支持体を連結する連結部； を含む、 核酸検出用支持体。

Description

本発明は、新規化合物およびその用途に関し、より具体的には、生体分子（例えば、核酸、タンパク質など）の標識が可能な化合物、前記化合物を含む生体分子標識または検出用組成物、前記化合物を含む生体分子標識または検出用支持体および前記化合物を用いて生体分子を標識または検出する方法に関する。 分子生物学、細胞生物学および分子遺伝学において生体内（ｉｎ ｖｉｖｏ）、生体外（ｉｎ ｖｉｔｒｏ）で生体分子を検出するか、細胞レベルの生物学的な現象を観察する検出標識として蛍光染料が使用されている。 蛍光染料を核酸、タンパク質などに標識して検出ラベルとして使用することは、様々な分野において広く応用されている。特に蛍光標識されたオリゴヌクレオチドは、ＤＮＡシーケンシング、蛍光ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、核酸アレイに対するハイブリダイゼーション分析、マイクロアレイ、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応を含む核酸増幅分析を含む様々な分析において有用に使用されている。 ＢＱＣＶ（ｂｌａｃｋ ｑｕｅｅｎ ｃｅｌｌ ｖｉｒｕｓ）ターゲットに対してＥＸ １－１およびＥＸ １－２による二重標識プローブを用いて２回繰り返したＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ結果を示すグラフである。ＢＱＣＶ（ｂｌａｃｋ ｑｕｅｅｎ ｃｅｌｌ ｖｉｒｕｓ）ターゲットに対してＥＸ １－３およびＥＸ １－４による二重標識プローブを用いて２回繰り返したＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ結果を示すグラフである。ＢＱＣＶ（ｂｌａｃｋ ｑｕｅｅｎ ｃｅｌｌ ｖｉｒｕｓ）ターゲットに対してＥＸ １－５およびＥＸ １－６による二重標識プローブを用いて２回繰り返したＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ結果を示すグラフである。ＢＱＣＶ（ｂｌａｃｋ ｑｕｅｅｎ ｃｅｌｌ ｖｉｒｕｓ）ターゲットに対してＥＸ １－７およびＥＸ １－８による二重標識プローブを用いて２回繰り返したＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ結果を示すグラフである。それぞれＥＸ １－１～ＥＸ １－８による二重標識プローブを使ったＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ １－１～ＥＸ １－８による二重標識プローブを使ったＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ １－１～ＥＸ １－８による二重標識プローブを使ったＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ １－１～ＥＸ １－８による二重標識プローブを使ったＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ １－１～ＥＸ １－８による二重標識プローブを使ったＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ １－１～ＥＸ １－８による二重標識プローブを使ったＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ １－１～ＥＸ １－８による二重標識プローブを使ったＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ １－１～ＥＸ １－８による二重標識プローブを使ったＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。ＢＱＣＶ（ｂｌａｃｋ ｑｕｅｅｎ ｃｅｌｌ ｖｉｒｕｓ）ターゲットに対してそれぞれＥＸ ２－１およびＥＸ ２－２による二重標識プローブを用いて２回繰り返したＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ結果を示すグラフである。ＢＱＣＶ（ｂｌａｃｋ ｑｕｅｅｎ ｃｅｌｌ ｖｉｒｕｓ）ターゲットに対してＥＸ ２－３およびＥＸ ２－４による二重標識プローブを用いて２回繰り返したＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ結果を示すグラフである。ＢＱＣＶ（ｂｌａｃｋ ｑｕｅｅｎ ｃｅｌｌ ｖｉｒｕｓ）ターゲットに対してＥＸ ２－５およびＥＸ ２－６による二重標識プローブを用いて２回繰り返したＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ結果を示すグラフである。ＢＱＣＶ（ｂｌａｃｋ ｑｕｅｅｎ ｃｅｌｌ ｖｉｒｕｓ）ターゲットに対してＥＸ ２－７およびＥＸ ２－８による二重標識プローブを用いて２回繰り返したＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ結果を示すグラフである。それぞれＥＸ ２－１～ＥＸ ２－８による二重標識プローブを用いたＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ ２－１～ＥＸ ２－８による二重標識プローブを用いたＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ ２－１～ＥＸ ２－８による二重標識プローブを用いたＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ ２－１～ＥＸ ２－８による二重標識プローブを用いたＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ ２－１～ＥＸ ２－８による二重標識プローブを用いたＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ ２－１～ＥＸ ２－８による二重標識プローブを用いたＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ ２－１～ＥＸ ２－８による二重標識プローブを用いたＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。それぞれＥＸ ２－１～ＥＸ ２－８による二重標識プローブを用いたＲｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ実験結果の標準曲線を示す図である。 本発明をより容易に理解するために、便宜上、特定の用語を本明細書に定義する。本明細書において別段の定義がない限り、本発明において使用される科学用語および技術用語は、当該技術分野における通常の知識を有する者が一般に理解する意味を有するものとする。 また、特に指定がない限り、単数形の用語は複数形も含み、複数形の用語は単数形も含むものとする。 さらに、本明細書において別段の定義がない限り、いかなる官能基も本発明の属する技術分野において一般的に認められている定義に従うものとする。 新規化合物 本発明の一態様によれば、下記の化学式１で表される新規化合物を提供する。 ここで、 Ｒ１～Ｒ４は、それぞれ独立に水素、置換されていてもよいＣ１－Ｃ４０アルキル、置換されていてもよいＣ１－Ｃ４０ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ２－Ｃ４０アルケニル、置換されていてもよいＣ２－Ｃ４０アルキニル、置換されていてもよいＣ３－Ｃ２０シクロアルキル、置換されていてもよいＣ３－Ｃ２０シクロアルケニル、置換されていてもよいＣ２－Ｃ２０ヘテロシクロアルキル、ヒドロキシ、オキシド（－Ｏ－）、置換されていてもよいＣ３－Ｃ４０シクロアルキルオキシ、置換されていてもよいＣ５－Ｃ４０アリールオキシ、置換されていてもよいＣ２－Ｃ４０ヘテロアリールオキシ、チオール、置換されていてもよいＣ５－Ｃ５０アルアルキル、置換されていてもよいＣ１－Ｃ４０アルキルチオ、置換されていてもよいＣ５－Ｃ４０アリールチオ、置換されていてもよいＣ３－Ｃ４０シクロアルキルチオ、置換されていてもよいＣ２－Ｃ４０ヘテロアリールチオ、置換されていてもよいアシルアミノ、アシルオキシ、スルホ基（ｓｕｌｆｏ ｇｒｏｕｐ)、置換されていてもよいアンモニウム、置換されたスルホン酸エステル、置換されていてもよいスルホンアミド、置換されたエステル、置換されていてもよいアミノカルボニル、ニトロソ（－Ｎ＝Ｏ）、置換されていてもよいシリル、置換されていてもよいアミド、置換されていてもよいカルバメート、ホスホ基（ｐｈｏｓｐｈｏ ｇｒｏｕｐ)、ニトリル、アセタール、ケタール、置換されていてもよいアミノ、アミノチオカルボニル、アミノカルボニルオキシ、アミノスルホニルオキシ、アミジノ基、スルホニルオキシ、イソニトリル、シアネート、イミド、イミニウム、エーテル、チオエーテル、ＲｘおよびＲｓから選択され、 Ｒ５～Ｒ１３は、それぞれ独立に水素、置換されていてもよいＣ１－Ｃ４０アルキル、置換されていてもよいＣ１－Ｃ４０ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ２－Ｃ４０アルケニル、置換されていてもよいＣ２－Ｃ４０アルキニル、置換されていてもよいＣ３－Ｃ２０シクロアルキル、置換されていてもよいＣ３－Ｃ２０シクロアルケニル、置換されていてもよいＣ２－Ｃ２０ヘテロシクロアルキル、ヒドロキシ、オキシド（－Ｏ－）、置換されていてもよいＣ１－Ｃ４０アルコキシ、置換されていてもよいＣ３－Ｃ４０シクロアルキルオキシ、置換されていてもよいＣ５－Ｃ４０アリールオキシ、置換されていてもよいＣ２－Ｃ４０ヘテロアリールオキシ、置換されていてもよいＣ５－Ｃ５０アリール、置換されていてもよいＣ２－Ｃ５０ヘテロアリール、チオール、置換されていてもよいＣ５－Ｃ５０アルアルキル、置換されていてもよいＣ１－Ｃ４０アルキルチオ、置換されていてもよいＣ５－Ｃ４０アリールチオ、置換されていてもよいＣ３－Ｃ４０シクロアルキルチオ、置換されていてもよいＣ２－Ｃ４０ヘテロアリールチオ、置換されていてもよいアシルアミノ、アシルオキシ、スルホ基（ｓｕｌｆｏ ｇｒｏｕｐ)、置換されていてもよいアンモニウム、置換されたスルホン酸エステル、置換されていてもよいスルホンアミド、置換されたエステル、置換されていてもよいアミノカルボニル、ニトロソ（－Ｎ＝Ｏ）、ハロゲン、置換されていてもよいシリル、置換されていてもよいアミド、置換されていてもよいカルバメート、ホスホ基（ｐｈｏｓｐｈｏ ｇｒｏｕｐ)、ニトリル、アセタール、ケタール、置換されていてもよいアミノ、アミノチオカルボニル、アミノカルボニルオキシ、アミノスルホニルオキシ、アミジノ基、スルホニルオキシ、イソニトリル、シアネート、イミド、イミニウム、エーテル、チオエーテル、ＲｘおよびＲｓから選択され、 Ｒ１～Ｒ１３のうち隣接する２つは、互いに結合して置換されていてもよい脂肪族環、置換されていてもよい芳香族環または置換されていてもよい脂肪族および芳香族混合環を形成することができ、 Ａ１およびＡ２は、それぞれ独立に水素、ハロゲン、置換されていてもよいＣ１－Ｃ１０アルキル、置換されていてもよいＣ３－Ｃ１０シクロアルキル、置換されていてもよいＣ１－Ｃ１０ヘテロシクロアルキル、置換されていてもよいＣ１－Ｃ１０ヘテロアルキル、置換されていてもよいＣ２－Ｃ１０アルケニル、置換されていてもよいＣ２－Ｃ１０アルキニル、置換されていてもよいＣ１－Ｃ１０アルコキシ、置換されていてもよいＣ５－Ｃ４０アリールオキシおよびシアノから選択され、ただし、Ａ１およびＡ２が同時に水素である場合を除く。 好ましくは、Ａ１およびＡ２のうち少なくとも１つは、置換されていてもよいＣ１－Ｃ３アルキルおよび置換されていてもよいＣ１－Ｃ５アルコキシ基で選択されるいずれか１つであってもよい。 Ｒｘは、反応基であるか、１～４０個の炭素原子を含む炭化水素を含むバックボーンに少なくとも１つの反応基が結合した基であり、 前記反応基は、カルボキシル、カルボキシル誘導体、カルボキシレート（－ＣＯ２ －）、カルボン酸塩、ヒドロキシル、親ジエン体、アルデヒド、置換されたケトン、スルホニルハライド、チオール、非置換されたアミノ、一級アミノ、アルケン、アルキン、ハロゲン、ヒドラジド、アジド、イミド、ケテン、イソシアネート、チオシアネート、イソチオシアネート、エポキシド、マレイミド、１，２，４，５－テトラジン誘導体、シクロアルキン誘導体、シクロアルケン、トリホスフェートおよびホスホロアミダイト、置換されたチオケトン、ハロホルミル、ホルミル、アシル、アシルアミド、アシルアジド、有機酸無水物（ａｎｈｙｄｒｉｄｅ）、アニリン、アジリジン、ボロネート、カルボジイミド、ジアゾアルキン、ハロアセトアミド、イミドエステル、グリコール