Search

JP-2026514819-A - 活性化可能な二特異性抗ＣＤ８９および抗ＰＤ－Ｌ１タンパク質ならびにそれらの使用

JP2026514819AJP 2026514819 AJP2026514819 AJP 2026514819AJP-2026514819-A

Abstract

PD-L1に特異的に結合し、疾患組織において活性化可能な特異的CD89結合も示すタンパク質分子が本明細書に提供される。さらに、がんを処置するためのこのようなタンパク質分子の使用が本明細書に提供される。このタンパク質分子は、重鎖を含む第1のポリペプチド鎖と、軽鎖を含む第2のポリペプチド鎖とを含み、前記重鎖が、N末端からC末端の順に、抗PD-L1重鎖可変(VH)ドメイン、第1のCH1ドメイン、第1のリンカー、抗CD89 VHドメイン、および第2のCH1ドメインを含み、前記軽鎖が、N末端からC末端の順に、抗PD-L1軽鎖可変(VL)ドメイン、第1の免疫グロブリン軽鎖定常領域、第2のリンカー、抗CD89 VLドメイン、および第2の免疫グロブリン軽鎖定常領域を含む。

Inventors

  • フィンレー， ウィリアム ジェイムズ ジョナサン

Assignees

  • センテッサ ファーマシューティカルズ （ユーケー） リミテッド

Dates

Publication Date
20260513
Application Date
20240419
Priority Date
20230419

Claims (20)

  1. 重鎖を含む第１のポリペプチド鎖と、軽鎖を含む第２のポリペプチド鎖とを含むタンパク質であって、 前記重鎖が、Ｎ末端からＣ末端の順に、抗ＰＤ－Ｌ１重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、第１のＣＨ１ドメイン、第１のリンカー、抗ＣＤ８９ ＶＨドメイン、および第２のＣＨ１ドメインを含み、 前記軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端の順に、抗ＰＤ－Ｌ１軽鎖可変（ＶＬ）ドメイン、第１の免疫グロブリン軽鎖定常領域、第２のリンカー、抗ＣＤ８９ ＶＬドメイン、および第２の免疫グロブリン軽鎖定常領域を含む、タンパク質。
  2. 前記重鎖が、Ｎ末端からＣ末端の順に、前記抗ＰＤ－Ｌ１ ＶＨドメイン、前記第１のＣＨ１ドメイン、前記第１のリンカー、前記抗ＣＤ８９ ＶＨドメイン、前記第２のＣＨ１ドメイン、ヒンジ、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインを含む、請求項１に記載のタンパク質。
  3. ヒンジおよびＦｃ領域を含む第３のポリペプチド鎖をさらに含む、請求項１または２に記載のタンパク質。
  4. 前記第３のポリペプチド鎖が、配列番号３２のアミノ酸配列を含む、請求項３に記載のタンパク質。
  5. 前記第１のリンカーが、配列番号１、配列番号２、配列番号３、または配列番号４のアミノ酸配列を含む、請求項１から４のいずれか一項に記載のタンパク質。
  6. 前記第２のリンカーが、配列番号１、配列番号２、配列番号３、または配列番号４のアミノ酸配列を含む、請求項１から６のいずれか一項に記載のタンパク質。
  7. 前記抗ＰＤ－Ｌ１ ＶＨドメインが、配列番号１２のアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１３のアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号１４のアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ３を含み、 前記抗ＰＤ－Ｌ１ ＶＬドメインが、配列番号１５のアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号１６のアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号１７のアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ３を含み、 前記抗ＣＤ８９ ＶＨドメインが、配列番号１８のアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ１、配列番号１９のアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ２、および配列番号２０のアミノ酸配列を含むＨＣＤＲ３を含み、 前記抗ＣＤ８９ ＶＬドメインが、配列番号２１のアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ１、配列番号２２のアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ２、および配列番号２３のアミノ酸配列を含むＬＣＤＲ３を含む、 請求項１から６のいずれか一項に記載のタンパク質。
  8. 前記抗ＰＤ－Ｌ１ ＶＨドメインが、配列番号２４のアミノ酸配列を含み、前記抗ＰＤ－Ｌ１ ＶＬドメインが、配列番号２５のアミノ酸配列を含む、請求項１から７のいずれか一項に記載のタンパク質。
  9. 前記抗ＣＤ８９ ＶＨドメインが、配列番号２６のアミノ酸配列を含む、請求項１から８のいずれか一項に記載のタンパク質。
  10. 前記抗ＣＤ８９ ＶＬドメインが、配列番号２７のアミノ酸配列を含む、請求項１から９のいずれか一項に記載のタンパク質。
  11. 前記重鎖が、配列番号３０または配列番号３１のアミノ酸配列を含む、請求項１から１０のいずれか一項に記載のタンパク質。
  12. 前記軽鎖が、配列番号２８または配列番号２９のアミノ酸配列を含む、請求項１から１１のいずれか一項に記載のタンパク質。
  13. （ａ）前記重鎖が、配列番号３０のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号２８のアミノ酸配列を含み、前記第３のポリペプチド鎖が、配列番号３２のアミノ酸配列を含む；または （ｂ）前記重鎖が、配列番号３１のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が、配列番号２９のアミノ酸配列を含み、前記第３のポリペプチド鎖が、配列番号３２のアミノ酸配列を含む、請求項３に記載のタンパク質。
  14. 前記重鎖が、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、またはＩｇＹ定常領域を含む、請求項２または３に記載のタンパク質。
  15. 前記重鎖が、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、またはＩｇＡ２定常領域を含む、請求項２または３に記載のタンパク質。
  16. 前記重鎖が、免疫学的に不活性な定常領域を含む、請求項２または３に記載のタンパク質。
  17. 前記重鎖が、野生型ヒトＩｇＧ１定常領域、アミノ酸置換Ｌ２３４Ａ、Ｌ２３５Ａ、およびＧ２３７Ａを含むヒトＩｇＧ１定常領域、野生型ヒトＩｇＧ２定常領域、野生型ヒトＩｇＧ４定常領域、またはアミノ酸置換Ｓ２２８Ｐを含むヒトＩｇＧ４定常領域を含み、番号付けが、ＫａｂａｔのようなＥＵインデックスに従う、請求項２または３に記載のタンパク質。
  18. 治療剤に連結された、請求項１から１７のいずれか一項に記載のタンパク質を含む、イムノコンジュゲート。
  19. 前記治療剤が、細胞毒性、放射性同位体、化学療法剤、免疫調節剤、細胞増殖抑制酵素、細胞溶解酵素、治療用核酸、抗血管新生剤、抗増殖剤、またはアポトーシス促進剤である、請求項１８に記載のイムノコンジュゲート。
  20. 請求項１から１７のいずれか一項に記載のタンパク質、または請求項１８もしくは１９に記載のイムノコンジュゲート、および薬学的に許容される担体、希釈剤、もしくは賦形剤を含む、医薬組成物。

Description

相互参照 本出願は、２０２３年４月１９日に出願された米国仮出願第６３／４９７，０９２号の利益を主張し、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。 技術分野 本開示は、活性化可能な二特異性タンパク質およびがんの処置に関する。 背景 免疫腫瘍学療法において、主要な薬物標的のほとんどは疾患組織にのみ発現するものではなく、大部分は非疾患組織においても発現している。加えて、がん処置に用いられる多くの薬物は、非常に強力な細胞死滅作用機序を利用している。その結果として、非疾患組織における薬物による標的の係合は、多くの場合、望ましくない副作用を引き起こす。 ＰＤ－Ｌ１は、免疫グロブリンスーパーファミリーのメンバーである細胞表面受容体であり、主に非疾患組織における骨髄性細胞および制御性Ｔ（Ｔｒｅｇ）細胞上で発現する。しかしながら、ＰＤ－Ｌ１は、一部のがん細胞上で高度に発現することも観察されている。ＰＤ－Ｌ１は膜タンパク質ＰＤ１に結合する。Ｔ細胞上でのＰＤ－Ｌ１とＰＤ１との相互作用は、Ｔ細胞の炎症活性を下方制御し、免疫自己寛容を促進する。したがって、ＰＤ－Ｌ１は免疫チェックポイントとして記載されている。それ故、ＰＤ１との相互作用を遮断するアンタゴニスト抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体は、抗がんＴ細胞応答を自然免疫抑制から解放することにより、がんなどの疾患環境において良好な耐容性を示す免疫療法剤として作用する可能性を実証している。そのため、ＰＤ－Ｌ１は、適応免疫系の抗がん効果を増幅させるために使用される薬物標的である。しかしながら、多くの場合、腫瘍は、抗ＰＤ－Ｌ１剤の効果を無効化するために複数の「回避機序」を使用し得る。 ＣＤ８９はＩｇＡに対する受容体であり、ＩｇＡ抗体の重鎖定常領域に結合する。ＣＤ８９は、好中球、単球、マクロファージ、および好酸球を含む、骨髄系細胞の細胞表面上に存在する。ＩｇＡによるＣＤ８９の結合および活性化は、ＩｇＡオプソニン化細胞に対する抗体依存性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）および抗体依存性細胞ファゴサイトーシス（ＡＤＣＰ）の強力な誘導をもたらし、これは類似のＩｇＧによって誘導される誘導よりも著しく強力であり得る。これらの観測にもかかわらず、ＩｇＡ抗体の構造は発現および精製することが困難であり、疾患組織における曝露を最小限にするヒトにおける不十分な薬物動態（ＰＫ）を被るため、治療剤としてのＩｇＡ抗体の開発は全体的に成功していない。 歴史的に、ＣＤ８９細胞外ドメインに対して生成された抗体は、内因性ＩｇＡとの結合を競合しない。ＣＤ８９と結合すると、これらの抗体は直接的な活性化シグナルを誘導することができ、自然免疫細胞の炎症活性の増加をもたらす。これらの抗体からの結合性ドメインを使用して、ＣＤ８９にライゲーションする二特異性剤も作製されており、これにより自然免疫細胞の死滅活性を標的が豊富な疾患組織に方向付けることができる。したがって、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、ＣＤ８９にも結合する能力を獲得することによって、より強力かつ広範に作用する治療剤となり得、これにより、ＰＤ－Ｌ１抗体耐性疾患環境において、自然免疫細胞の死滅機序を強力に増強する。これは、主要なチェックポイント阻害剤の機能を誘導可能な「合成ＩｇＡ免疫」と組み合わせ、適応免疫系を相乗的に刺激することが可能となる。しかしながら、この組合せを単一の治療剤構造において（例えば、完全に活性なＰＤ－Ｌ１およびＣＤ８９結合性ドメインを有する標準的な二特異性抗体フォーマットにおいて）機能させる能力は、Ｔ細胞および自然免疫細胞、ならびにその他などの多くの細胞型でのＰＤ－Ｌ１およびＣＤ８９の両方の比較的広範な発現プロファイルによって制限される。この広範な発現プロファイルは、ＰＤ－Ｌ１／ＣＤ８９結合剤に対する用量制限毒性だけでなく、複合的な機序を活用するために疾患組織において高度に十分な曝露を達成するこのような薬剤の能力を制限する、深刻な末梢シンク（sink）／生体内分布の問題も引き起こし得る。したがって、疾患組織環境を特異的に標的とする活性を有する操作された形態の二特異性結合タンパク質に対する必要性が存在している。 図１は、インタクト（左）、活性化プロテアーゼ切断（中央）、および不活性化プロテアーゼ切断（右）のコンフォメーションにおける本明細書に開示されるタンパク質分子の例示的な非対称的な１本のアームの構築物の図を示す。インタクトなコンフォメーションでは、抗ＰＤ－Ｌ１ Ｆａｂ結合性ドメインは曝露され、それらのコグネイト標的に結合することができる。抗ＣＤ８９ Ｆａｂドメインは、重鎖および軽鎖の両方におけるリンカーによって結合が阻害され、これらのリンカーは両方ともタンパク質分解により切断可能であり、マトリクスメタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）および／またはカテプシンによって順次切断され得る。第１の切断事象により、単一のタンパク質構築物由来の抗ＰＤ－Ｌ１および抗ＣＤ８９ Ｆａｂの両方がそれらのコグネイト標的に結合することを可能にする中間活性状態が生じ、これにより、ＰＤ－Ｌ１＋免疫抑制微小環境においてＣＤ８９＋免疫細胞の活性化を方向付ける可能性がある。第２の切断により、抗ＰＤ－Ｌ１および抗ＣＤ８９のＦａｂが解離され、単一分子がＰＤ－Ｌ１およびＣＤ８９の両方に同時に結合する能力が取り除かれる。 図２は、本明細書に提供される活性化可能な二特異性タンパク質分子の活性の機序の図を示す。ＣＤ８９結合性ドメインの解放された活性は本質的に単量体であるため、これは直接的にＣＤ８９活性化を引き起こすことができず、ＰＤ－Ｌ１＋細胞への結合に依存し、近傍の免疫細胞に対してトランスでＣＤ８９結合の提示をもたらして、ＣＤ８９シグナル伝達を誘導する。活性化された分子は、これにより、ＰＤ－Ｌ１／ＰＤ１シグナル伝達を同時に遮断して、Ｔ細胞における阻害されないＴＣＲ活性化を復活させ、ＣＤ８９シグナル伝達を提供して、自然免疫細胞のＡＤＣＣおよびＡＤＣＰ活性を増幅させる。 図３は、本明細書に記載されるタンパク質分子の例示的な対称的な２本のアームの構築物の構造を示す。 詳細な説明 腫瘍学に関してＣＤ８９活性化、腫瘍標的化二特異性抗体薬物の有効性を制限する２つの主要な問題がある： １）がん細胞上に見出される抗体標的タンパク質（例えば、ＰＤ－Ｌ１）は、腫瘍細胞だけでなく、体内の多くの異なる細胞クラス上で発現する可能性があることである。この腫瘍外標的発現は、標準的な二特異性分子におけるＣＤ８９結合性ドメインが構成的に活性であり、したがって、ＰＤ－Ｌ１＋細胞が疾患組織内にあるか否かにかかわらず、あらゆるＰＤ－Ｌ１＋細胞の存在下でＣＤ８９＋細胞の活性化を方向付け得るため、用量制限副作用のリスクをもたらす場合がある。また腫瘍外標的発現は、抗原の「シンク」効果ももたらす場合があり、これにより、腫瘍に浸潤する薬物の量が低減する。 ２）好中球および単球などのＣＤ８９陽性細胞は、血流中および他の組織では高濃度に見出され、このアームに対して大きなシンク効果を生じ、生体内分布および腫瘍への浸潤に利用可能な遊離薬物に影響を与える。 上記で説明した両方の要因は、ＣＤ８９の係合および活性化を駆動する二特異性抗体の潜在的な安全性および有効性を最小限に抑える。本明細書に提供される抗ＰＤ－Ｌ１および抗ＣＤ８９タンパク質（例えば、図１を参照のこと）は、疾患組織外でのＣＤ８９の結合を最小限に抑えることにより末梢シンクおよび毒性の問題を克服する。この効果は、ＣＤ８９結合性ドメインの上方（すなわちアミノ末端側）にＰＤ－Ｌ１結合性ドメインおよびリンカーを追加することにより達成される。適切な上方ドメインおよびリンカーの組合せの使用により、下方（すなわちカルボキシ末端）のＣＤ８９ドメインにおける結合活性を最小化する構成が得られる。次いでＰＤ－Ｌ１ドメインは、ＰＤ－Ｌ１が豊富な腫瘍微小環境において高濃度を駆動する。このタンパク質構築物リンカー系は、固形腫瘍に共通するＭＭＰおよびカテプシン活性の上昇を利用してリンカーペプチドを切断し、ＣＤ８９結合性ドメインを曝露し、これにより末梢ではなく、腫瘍内で条件付きでＣＤ８９活性化活性を活性化させる。これにより、これらの複合的な生物学的機能は、図２に概説されるように、分子に、末梢ＣＤ８９シンクを回避し、がん細胞に対するＴ細胞免疫応答を最大化する可能性を与える。 疾患のあるヒト組織において条件付きで活性化するタンパク質が本明細書に提供される。本開示のタンパク質は、全身にわたってＰＤ－Ｌ１を特異的に結合し、遮断する際に完全に活性であり；健康な組織ではＣＤ８９の最小限の結合を示し；ＰＤ－Ｌ１陽性の疾患組織環境内にあると、ＣＤ８９の結合および活性化において高度に活性化される。本開示のタンパク質は、非疾患組織においてＰＤ－Ｌ１結合性ドメインによってマスクされるＣＤ８９結合性ドメインを含む。また、タンパク質は、疾患組織（例えば、腫瘍）内で発現する１つまたは複数のプロテアーゼによって切断される２つのペプチドリンカーも含む。リンカーの切断により、疾患組織内でＣＤ８９結合性ドメインのマスクが外され、これにより疾患組織において選択的にタンパク質の結合および／または機能が可能となる。 タンパク質分子 ２つのＦａｂ断片（抗ＰＤ－Ｌ１ Ｆａｂおよび抗ＣＤ８９ Ｆａｂ）を含むタンパク質が本明細書に提供される。このタンパク質は、二価の活性化抗ＣＤ８９抗体に関連する末梢毒性のリスクを最小化するために、インタクトな構造の場合、一価であり、活性化されると、最大でも一価のＣＤ８９結合しか有することができない。 一部の実施形態では、タンパク質は、重鎖を含む第１のポリペプチド鎖と、軽鎖を含む第２のポリペプチド鎖とを含み、重鎖が、Ｎ末端からＣ末端の順に、抗ＰＤ－Ｌ１重鎖可変（ＶＨ）ドメイン、第１のＣＨ１ドメイン、第１のリンカー、抗ＣＤ８９ ＶＨドメイン、および第２のＣＨ１ドメインを含み、軽鎖が、Ｎ末端からＣ末端の順に、抗ＰＤ－Ｌ１軽鎖可変（ＶＬ）ドメイン、第１の免疫グロブリン軽鎖定常領域、第２のリンカー、抗ＣＤ８９ ＶＬドメイン、および第２の免疫グロブリン軽鎖定常領域を含む。一部の実施形態では、重鎖は、免疫グロブリンヒンジ領域およびＦｃドメインをそのＣ末端にさらに含む。一部の実施形態では、重鎖は、Ｎ末端からＣ末端の順に、抗ＰＤ－Ｌ１ ＶＨドメイン、第１のＣＨ１ドメイン、第１のリンカー、抗ＣＤ８９ ＶＨドメイン、第２のＣＨ１ドメイン、ヒンジ、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインを含む。 一部の実施形態では、タンパク質は、ヒンジおよびＦｃ領域を含む第３のポリペプチド鎖をさらに含む。第３のポリペプチド鎖は、「Ｆｃ－ｓｔｕｍｐ」と称されることがある。 ドメインが標識された本開示の例示的なタンパク質の図が図１に示される。 第１のリンカーおよび第２のリンカーは、腫瘍などの疾患組織に見出されるマトリクスメタロプロテアーゼ（ＭＭＰ）および／またはカテプシンによって切断可能である。タンパク質内のリンカーは、タンパク質分解に感受性であるとともに順次切断され得る免疫グロブリン由来のヒンジ配列であり、第１の切断はインタクトな構造で行われ、中間の活性状態を生じ、これにより、単一のタンパク質構築物由来の抗ＰＤ－Ｌ１ Ｆａｂおよび抗ＣＤ８９ Ｆａｂが、それらのコグネイト標的に結合することが可能となる。第２のリンカーにおける第２の切断事象により、抗ＰＤ－Ｌ１ Ｆａｂと抗ＣＤ８９ Ｆａｂとの間の共有結合が除去され、ＰＤ－Ｌ１＋細胞のＴ細胞死滅を動員する分子の能力が失われる。この二次切断事象は、これにより、活性化分子が腫瘍微小環境を回避するリスクを最小化する「自己破壊機序」を構成する。免疫グロブリンヒンジ配列に基づく切断リンカーはまた、自己反応性基礎疾患を有する（さらには有しない）ヒト患