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KR-20260061212-A - 인히빈 서브유닛 베타 E (INHBE)의 발현을 억제하기 위한 RNAi 작용제, 그의 제약 조성물, 및 사용 방법

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Abstract

본 개시내용은 인히빈 서브유닛 베타 E (INHBE) 유전자 발현을 억제할 수 있는 RNAi 작용제, 예를 들어 이중 가닥 RNAi 작용제, 예컨대 siRNA에 관한 것이다. INHBE RNAi 작용제를 포함하는 제약 조성물 및 그의 사용 방법이 또한 개시된다. 본원에 개시된 INHBE RNAi 작용제는 간세포를 포함한 세포로의 전달을 용이하게 하기 위해 표적화 리간드에 접합될 수 있다. 생체내 INHBE RNAi 작용제의 전달은 INHBE 유전자 발현의 억제를 제공한다. RNAi 작용제는 비만, 당뇨병, 간 염증, 이상지혈증 또는 대사 질환과 같은, INHBE 유전자 발현에 의해 부분적으로 매개되는 질환, 장애 또는 증상의 치료 방법에 사용될 수 있다.

Inventors

  • 응가이, 미쉘
  • 브라스, 다니엘
  • 리우, 펭
  • 리, 푸후이
  • 리, 샤오카이
  • 딩, 지-밍
  • 페이, 타오
  • 웡, 소
  • 해밀턴, 제임스
  • 셰흐트만, 그리고리

Assignees

  • 애로우헤드 파마슈티컬스 인코포레이티드

Dates

Publication Date
20260506
Application Date
20240829
Priority Date
20230830

Claims (20)

  1. 인히빈 서브유닛 베타 E (INHBE) 유전자의 발현을 억제하기 위한 RNAi 작용제로서, i. 표 2, 표 3, 또는 표 5C의 서열 중 어느 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 적어도 17개의 인접 뉴클레오티드를 포함하는 안티센스 가닥; 및 ii. 안티센스 가닥에 대해 적어도 부분적으로 상보적인 뉴클레오티드 서열을 포함하는 센스 가닥 을 포함하는 RNAi 작용제.
  2. 제1항에 있어서, 안티센스 가닥이 표 2, 표 3 또는 표 5C의 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 2-18을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  3. 제1항 또는 제2항에 있어서, 센스 가닥이 표 2, 표 4 또는 표 5C의 센스 가닥 서열 중 어느 하나의 15개의 인접 뉴클레오티드와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 적어도 15개의 인접 뉴클레오티드의 뉴클레오티드 서열을 포함하고, 센스 가닥이 안티센스 가닥에 대해 17개의 인접 뉴클레오티드에 걸쳐 적어도 85% 상보성의 영역을 갖는 것인 RNAi 작용제.
  4. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, RNAi 작용제의 적어도 1개의 뉴클레오티드가 변형된 뉴클레오티드이거나 또는 변형된 뉴클레오시드간 연결을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  5. 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, RNAi 작용제의 센스 및/또는 안티센스 가닥의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드가 변형된 뉴클레오티드인 RNAi 작용제.
  6. 제4항 또는 제5항에 있어서, 변형된 뉴클레오티드가 2'-O-메틸 뉴클레오티드, 2'-플루오로 뉴클레오티드, 2'-데옥시 뉴클레오티드, 2',3'-세코 뉴클레오티드 모방체, 잠금 뉴클레오티드, 2'-F-아라비노 뉴클레오티드, 2'-메톡시에틸 뉴클레오티드, 무염기성 뉴클레오티드, 리비톨, 역전된 뉴클레오티드, 역전된 2'-O-메틸 뉴클레오티드, 역전된 2'-데옥시 뉴클레오티드, 2'-아미노-변형된 뉴클레오티드, 2'-알킬-변형된 뉴클레오티드, 모르폴린 뉴클레오티드, 비닐 포스포네이트 함유 뉴클레오티드, 시클로프로필 포스포네이트 함유 뉴클레오티드, 및 3'-O-메틸 뉴클레오티드로 이루어진 군으로부터 선택된 것인 RNAi 작용제.
  7. 제5항에 있어서, 모든 또는 실질적으로 모든 변형된 뉴클레오티드가 2'-O-메틸 뉴클레오티드, 2'-플루오로 뉴클레오티드 또는 그의 조합인 RNAi 작용제.
  8. 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 안티센스 가닥이 표 3 또는 표 5C의 변형된 안티센스 가닥 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  9. 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 센스 가닥이 표 4 또는 표 5C의 변형된 센스 가닥 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  10. 제1항에 있어서, 안티센스 가닥이 표 3 또는 표 5C의 변형된 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열을 포함하고, 센스 가닥이 표 4 또는 표 5C의 변형된 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  11. 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 표적화 리간드에 연결된 RNAi 작용제.
  12. 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 표적화 리간드가 아시알로당단백질 수용체에 대해 친화도를 갖는 것인 RNAi 작용제.
  13. 제11항 또는 제12항에 있어서, 표적화 리간드가 N-아세틸-갈락토사민을 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  14. 제11항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 표적화 리간드가 (NAG37) 또는 (NAG37)s의 구조를 포함하는 것인 RNAi 작용제.
  15. 제11항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서, 표적화 리간드가 센스 가닥에 연결된 것인 RNAi 작용제.
  16. 제15항에 있어서, 표적화 리간드가 센스 가닥의 5' 말단 단부에 연결된 것인 RNAi 작용제.
  17. 제1항 내지 제16항 중 어느 한 항에 있어서, 센스 가닥이 15 내지 30개 뉴클레오티드 길이이고, 안티센스 가닥이 18 내지 30개 뉴클레오티드 길이인 RNAi 작용제.
  18. 제17항에 있어서, 센스 가닥 및 안티센스 가닥이 각각 18 내지 27개 뉴클레오티드 길이인 RNAi 작용제.
  19. 제18항에 있어서, 센스 가닥 및 안티센스 가닥이 각각 18 내지 24개 뉴클레오티드 길이인 RNAi 작용제.
  20. 제19항에 있어서, 센스 가닥 및 안티센스 가닥이 각각 21개 뉴클레오티드 길이인 RNAi 작용제.

Description

인히빈 서브유닛 베타 E (INHBE)의 발현을 억제하기 위한 RNAi 작용제, 그의 제약 조성물, 및 사용 방법 관련 출원에 대한 상호 참조 본 출원은 2023년 8월 30일에 출원된 미국 특허 가출원 일련 번호 63/579,708, 2024년 1월 5일에 출원된 미국 특허 가출원 일련 번호 63/618,015, 2024년 4월 15일에 출원된 미국 특허 가출원 일련 번호 63/634,173, 및 2024년 8월 14일에 출원된 미국 특허 가출원 일련 번호 63/683,209에 대한 우선권의 이익을 주장하며, 이들 각각의 내용은 그 전문이 본원에 참조로 포함된다. 기술 분야 본 개시내용은 인히빈 서브유닛 베타 E (INHBE)의 억제를 위한 RNA 간섭 (RNAi) 작용제, 예를 들어 이중 가닥 RNAi 작용제, 예컨대 소형 또는 짧은 간섭 RNA (siRNA), INHBE RNAi 작용제를 포함하는 제약 조성물, 및 그의 사용 방법에 관한 것이다. 서열 목록 본 출원은 xml 포맷으로 제출된 서열 목록 (표준 ST26을 준수함)을 함유하며, 이는 그 전문이 본원에 참조로 포함된다. xml 서열 목록 파일은 30713-WO_SeqListing.xml로 명명되고, 2024년 8월 26일에 생성되었으며, 크기는 3112 kb이다. 인히빈 서브유닛 베타 E (INHBE)는 주로 간에서 발현되고 전전구단백질을 코딩하며, 이는 단백질분해적으로 절단되어 성숙 베타 펩티드를 방출한다. 성숙 펩티드의 동종이량체화는 액티빈 E 단백질의 생산으로 이어진다. 형질전환 성장 인자-베타 (TGF베타) 슈퍼패밀리의 구성원으로서, 액티빈 단백질은 SMAD 활성화를 통해 표적 유전자의 전사체를 조절하고, 문헌은 성장, 신체 조성, 지방증 및 에너지 대사의 조절에서 그의 역할을 연루시킨다. 전체-엑솜 서열분석 연구에서, 연구원들은 감소된 복부 비만 표현형 및 유리한 심혈관대사 프로파일과 연관된 예측되는 기능 상실을 갖는 희귀 변이체 (NM_031479.4:c.299-1 G>C, NM_0314794.4:C.298+1 G>T, p.Tyr253Ter)를 확인하였다 (Deaton AM, et al., Rare loss of function variants in the hepatokine gene INHBE protect from abdominal obesity, Nat Commun. (July 2022); 13:4319). 이들 변이체의 이형접합 보인자는 감소된 허리-대-엉덩이 조정된 BMI, 보다 낮은 트리글리세리드, 보다 높은 HDL 콜레스테롤, 감소된 알라닌 아미노트랜스퍼라제 및 보다 낮은 공복 글루코스와 연관된다. 제2형 당뇨병 및 관상동맥 심장 질환의 보다 적은 사례가 또한 이들 INHBE 기능 상실 변이체의 보인자에서 확인된다. 추가적으로, 간 생검에 대한 RNA 발현 분석은 마른 원숭이 대비 NAFLD를 갖는 비만 원숭이에서 증가된 INHBE 발현을 보여준다. 이러한 연구에서의 발견은 INHBE를 대사 조절을 위한 후보 표적 유전자로서 확인했던 이전의 보다 소규모의 연구를 지지하였다. INHBE는 상대적으로 이해되며, 복부 비만과 그의 연관성의 기저가 되는 작용 메카니즘은 아직 완전히 이해되지 않는다. 그러나, 당뇨병 뮤린 모델에서 INHBE를 녹다운시키기 위해 siRNA를 이용한 전임상 연구는 INHBE의 보통의 감소가 체중 증가의 억제, 제지방 질량 조성의 증가, 및 지방량 부피의 감소로 이어질 수 있다는 것을 입증하였다 (Sugiyama M, et al., Inhibin E (INHBE) is a possible insulin resistance-associated hepatokine identified by comprehensive gene expression analysis in human liver biopsy samples, PLoS ONE. (Feb 2018); 13(3):e0194798). 이들 일련의 증거는 INHBE가 잠재적 치료 표적이고, 억제는 복부 비만 및 심혈관대사 질환과 관련하여 유리한 표현형으로 이어질 수 있다는 것을 시사한다. 표 2, 표 3, 또는 표 5C의 서열 중 어느 하나와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 적어도 17개의 인접 뉴클레오티드를 포함하는 안티센스 가닥; 및 안티센스 가닥에 대해 적어도 부분적으로 상보적인 뉴클레오티드 서열을 포함하는 센스 가닥을 포함하는, INHBE 유전자의 발현을 억제하기 위한 RNAi 작용제가 본원에 개시된다. 일부 실시양태에서, 안티센스 가닥은 표 2, 표 3, 또는 표 5C의 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 2-18을 포함한다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥은 표 2 또는 표 4의 센스 가닥 서열 중 어느 하나의 15개의 인접 뉴클레오티드와 0 또는 1개의 뉴클레오티드만큼 상이한 적어도 15개의 인접 뉴클레오티드의 뉴클레오티드 서열을 포함하고, 센스 가닥은 안티센스 가닥에 대해 15개의 인접 뉴클레오티드에 걸쳐 적어도 85% 상보성 영역을 갖는다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 적어도 1개의 뉴클레오티드는 변형된 뉴클레오티드이거나 또는 변형된 뉴클레오시드간 연결을 포함한다. 일부 실시양태에 따르면, RNAi 작용제의 센스 및/또는 안티센스 가닥의 모든 또는 실질적으로 모든 뉴클레오티드는 변형된 뉴클레오티드이다. 일부 실시양태에서, 변형된 뉴클레오티드는 2'-O-메틸 뉴클레오티드, 2'-플루오로 뉴클레오티드, 2'-데옥시 뉴클레오티드, 2',3'-세코 뉴클레오티드 모방체, 잠금 뉴클레오티드, 2'-F-아라비노 뉴클레오티드, 2'-메톡시에틸 뉴클레오티드, 무염기성 뉴클레오티드, 리비톨, 역전된 뉴클레오티드, 역전된 2'-O-메틸 뉴클레오티드, 역전된 2'-데옥시 뉴클레오티드, 2'-아미노-변형된 뉴클레오티드, 2'-알킬-변형된 뉴클레오티드, 모르폴린 뉴클레오티드, 비닐 포스포네이트-함유 뉴클레오티드, 시클로프로필 포스포네이트-함유 뉴클레오티드, 및 3'-O-메틸 뉴클레오티드로 이루어진 군으로부터 선택된다. 특정 실시양태에서, 모든 또는 실질적으로 모든 변형된 뉴클레오티드는 2'-O-메틸 뉴클레오티드, 2'-플루오로 뉴클레오티드 또는 그의 조합이다. 일부 실시양태에서, 안티센스 가닥은 표 3의 변형된 안티센스 가닥 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함한다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥은 표 4의 변형된 센스 가닥 서열 중 임의의 것의 뉴클레오티드 서열로 이루어지거나, 그로 본질적으로 이루어지거나, 또는 그를 포함한다. 일부 실시양태에서, 안티센스 가닥은 표 3의 변형된 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열을 포함하고, 센스 가닥은 표 4의 변형된 서열 중 어느 하나의 뉴클레오티드 서열을 포함한다. 특정 실시양태에서, RNAi 작용제는 표적화 리간드에 연결된다. 일부 실시양태에서, 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다. 특정 실시양태에서, 표적화 리간드는 (NAG37) 또는 (NAG37)s의 구조를 포함한다. 특정 실시양태에서, 표적화 리간드는 센스 가닥에 연결된다. 일부 실시양태에서, 표적화 리간드는 센스 가닥의 5' 말단 단부에 연결된다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥은 15 내지 30개 뉴클레오티드 길이이고, 안티센스 가닥은 18 내지 30개 뉴클레오티드 길이이다. 다른 실시양태에서, 센스 가닥 및 안티센스 가닥은 각각 18 내지 27개 뉴클레오티드 길이이다. 다른 실시양태에서, 센스 가닥 및 안티센스 가닥은 각각 18 내지 24개 뉴클레오티드 길이이다. 또 다른 실시양태에서, 센스 가닥 및 안티센스 가닥은 각각 21개 뉴클레오티드 길이이다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제는 2개의 평활 단부를 갖는다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥은 1 또는 2개의 말단 캡을 포함한다. 다른 실시양태에서, 센스 가닥은 1 또는 2개의 역전된 무염기성 잔기를 포함한다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제는 표 5A, 5B 또는 5C에 제시된 듀플렉스 구조 중 어느 하나의 듀플렉스 서열을 형성하는 센스 가닥 및 안티센스 가닥으로 구성된다. 일부 실시양태에서, 센스 가닥은 뉴클레오티드 서열의 3' 말단 단부, 뉴클레오티드 서열의 5' 단부 또는 둘 다에 역전된 무염기성 잔기를 추가로 포함한다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제의 센스 가닥은 표적화 리간드에 연결된다. 일부 실시양태에서, 표적화 리간드는 아시알로당단백질 수용체에 대한 친화도를 갖는다. 일부 실시양태에서, 표적화 리간드는 N-아세틸-갈락토사민을 포함한다. 추가 실시양태에서, 표적화 리간드는 하기를 포함한다: . 또한, 개시된 RNAi 작용제를 포함하는 조성물이 본원에 개시되며, 여기서 조성물은 제약상 허용되는 부형제를 추가로 포함한다. 또한, 세포에서 INHBE 유전자의 발현을 억제하는 방법이 본원에 제공되며, 상기 방법은 유효량의 개시된 RNAi 작용제 또는 개시된 조성물을 세포 내로 도입하는 것을 포함한다. 일부 실시양태에서, 세포는 대상체 내의 것이다. 일부 실시양태에서, 대상체는 인간 대상체이다. 일부 실시양태에서, INHBE 유전자 발현은 적어도 약 30% 억제된다. 일부 실시양태에서, INHBE 유전자 발현은 간세포의 세포질에서 적어도 약 50% 억제된다. 추가로, INHBE-관련 질환, 장애 또는 증상을 치료하는 방법이 본원에 제공되며, 상기 방법은 INHBE-관련 질환, 장애 또는 증상의 치료를 필요로 하는 인간 대상체에게 치료 유효량의 개시된 조성물을 투여하는 것을 포함한다. 일부 실시양태에서, 질환은 비만, 당뇨병, 간 염증, 이상지혈증 또는 대사 질환이다. 일부 실시양태에서, RNAi 작용제는 인간 대상체의 체중을 기준으로 약 0.05 mg/kg 내지 약 5.0 mg/kg의 용량으로 투여된다. 다른 실시양태에서, RNAi 작용제는 2회 이상의 용량으로 투여된다. 또한, INHBE 유전자 발현에 의해 적어도 부분적으로 매개되는 질환, 장애 또는 증상의 치료를 위한 개시된 RNAi 작용제 또는 개시된 조성물의 용도가 본원에 제공된다. 일부 실시양태에서, 질환은 비만, 당뇨병, 간 염증, 이상지혈증 또는 대사 질환이다. 추가로, INH